以下の手順で削除ができます。

1.Internet Explorer で、[ツール]ボタンを選び、[セーフティ] をポイント

2.[閲覧の履歴の削除] を選択

3.[クッキーとWebサイトデータ]チェックボックスをオン

4.[削除] を選択

※すべての Cookie を削除すると、一部の Web ページが
　正常に表示されなくなることがあります。
※[お気に入り Web サイト データの保持] チェックボックスがオンになってる場合、
　お気に入りに登録しているサイトのCookieは削除をしても消えません。
※Cookie を削除したくないサイトはお気に入りに登録をお願いいたします。

その他のバージョンやMicrosoft Edgeをご利用方は以下をご参照ください。
■Windows 10のヘルプ
https://support.microsoft.com/ja-jp/products/windows?os=windows-10
■Cookie の削除と管理を行う
https://support.microsoft.com/ja-jp/help/17442/windows-internet-explorer-delete-manage-cookies#ie=ie-11