明治 44 年(1911 年) 九州帝国大学工科大学創設
大正 09 年(1920 年) 造船学科設置，2 講座編成（造船学第一，造船学第二）
大正 10 年(1921 年) 造船学第三講座及び第四講座の 2 講座が増設される．
大正 11 年(1922 年) 造船学第五講座増設，5 講座体制となる．
昭和 08 年(1933 年) 造船学科に航空学 1 講座が増設される．
昭和 12 年(1937 年) 航空工学科が分離独立により再び 5 講座体制となる．
昭和 39 年(1964 年) 造船学第一（船体強度理論及び船体振動学），造船学第二（流体力学及び船舶運動論），造船学第三（船体構造及び商船設計），造船学第四（船舶抵抗論及び船舶推進論），造船学第五（造船工作論及び商船艤装）の 5 講座体制となる．
昭和 45 年(1970 年) 造船学第六（船舶溶接工学及び熱塑性加工学）講座が増設され 6 講座体制となる．
平成 04 年(1992 年) 造船学科の改組により船舶海洋システム工学科となる．
平成 10 年(1998 年) 九州大学の大学院重点化にともない，船舶海洋システム工学科，建設都市工学科および資源工学科が合同して地球環境工学科となる。学科内の専門教育コースの 1 つとして船舶海洋システム工学コースが設けられる．
平成 12 年(2000 年) 研究院制度の導入により，大学院工学研究院海洋システム工学部門および大学院工学府海洋システム工学専攻が設置される．
令和0３年（2021 年）学部及び大学院改組により，学部1年～2年前期は工学部IV群，2年後期からは船舶海洋工学科となる．大学院は船舶海洋工学専攻となる．

沿岸・海洋・船舶工学に係わる要素技術ならびに機器運航制御技術などの周辺技術を深く追求するとともに，各種の要素・周辺技術の学問的成果を横断的に総合して，海洋のもつ流通，生産，利用空間などの機能を活用するためのシステムの構築および船舶・海洋機器の開発，沿岸利用技術に関する高度な専門知識と総合計画能力を持つ技術者と研究者を育成することを教育と研究の目標としています。

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