昭和30年度お年玉付年賀はがき寄付金を基として、昭和32年1月 着工、同年3月荒金別府市長を会長として、財団法人設立の認可を受け、同年8月完成した。昭和32年10月21日 飯田 忠氏を初代理事長として別府整肢園を開園した。

設立の経緯
昭和32年 3月 　財団法人別府整肢園を設立（認可）
昭和32年10月　 肢体不自由児施設別府整肢園を開園
昭和33年 3月　 社会福祉法人別府整肢園に変更（認可）
昭和53年 4月　 肢体不自由児施設通園部こじか園を開設
昭和56年 4月　 知的障害児通園施設ひばり園を開設
平成 4年 4月　　重症心身障害児施設めじろ園を開設
平成 4年 8月　　法人名を別府発達医療センターに変更
平成12年 4月　 地域支援センターほっとを開設
平成17年 9月　 診療所大分療育クリニックを開所
平成17年10月　 心身障害者小規模作業所りんくを開所
平成19年 4月　 大分療育センターを開設し、大分療育クリニックを廃止

代表者略歴
理事長　福永　拙
昭和60年 4月　　大分医科大学附属病院整形外科 入局
平成 9年 4月　　 大分医科大学整形外科学講座整形外科講師
平成11年 4月　　（福）別府発達医療センター 副所長 兼 別府整肢園副園長
平成15年 4月　　（福）別府発達医療センター 理事、所長（現ｾﾝﾀｰ長） 兼 別府整肢園長
平成29年 6月　　（福）別府発達医療センター 副理事長
平成31年 2月　　（福）別府発達医療センター 理事長
　　　　　　　　　現在に至る

　当センターでは、別府市と大分市に施設を設け、県内において、障がい児（者）の暮らしと発達をサポートするための様々な事業を行っています。
　外来サービスでは、整形外科、リハビリテーション科、小児科、精神科、耳鼻咽喉科、歯科・歯科口腔外科を行っています。また、訪問診療、訪問リハビリテーション等にも力を入れています。
　入園サービスでは、18歳までの手足や体に障がいのあるお子さんを対象とした肢体不自由児施設「別府整肢園」、重度重複障がいのある方を対象とした重症心身障害児施設「めじろ園」があり、専門の医療・リハビリテーションをはじめ、様々なスタッフが機能回復、生活全般の質の向上を目指した支援を行っています。
　通園サービスでは、別府市に児童発達支援センター「ひばり園」、大分市に同「こじか園」があり、基本的生活習慣、対人関係、集団参加等の能力を身につけることを目的に保育やリハビリテーションを行っています。また、生活介護事業所「りんく」では、利用者の運動機能等の低下を防止するとともに、その発達を促し、日常生活の支援を行い、社会参加の場としての環境づくりに取り組んでいます。
　地域支援センターほっとでは、日中活動サービス（生活介護、放課後等デイサービス）や訪問サービス（居宅介護、重度訪問介護、行動援護）、別府市からの委託事業（日中一時支援、移動支援）等のサービスを提供しています。
　その他、相談支援事業所「ぱれっと」では、障害児相談支援事業、障害者計画相談支援事業や、大分県・大分市から委託を受けて、巡回相談、施設支援、訪問療育、外来保育等の地域療育等支援事業、別府市から委託を受けて、基幹相談支援センター事業等を行ってます。

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