「一緒に音楽をやろう！」1972年、指揮者・小澤征爾のもと楽員による自主運営のオーケストラとして創立。
97年より葛飾北斎生誕地、国技館等で知られる東京都墨田区に本拠地を移転、すみだトリフォニーホールで日常の練習と公演を行う日本初の本格的フランチャイズを導入。定期演奏会等のほか学校・各種施設での地域に根ざした演奏活動も特徴的。
99年より桂冠名誉指揮者に小澤征爾が就任。2003年、音楽監督にクリスティアン･アルミンクが就任、若手指揮者の異例の抜擢に注目を集めた。
04年夏からは音楽家･久石譲と新プロジェクト“新日本フィル･ワールド･ドリーム･オーケストラ”を立ち上げた他、映画「千と千尋の神隠し」「ハウルの動く城」「崖の上のポニョ」では管弦楽を担当。また楽員の自主発案による『室内楽シリーズ』を始め、いずれも高い評価と人気を得ている。スペイン公演でも現地で高い評価を得た。
アルミンク就任以来毎年取り上げた演出付コンサート・オペラの評価は常に高く、06年『火刑台上のジャンヌ・ダルク』で三菱信託音楽賞奨励賞を受賞。以後『ローエングリン』（07年）『ペレアスとメリザンド』（10年）等でも最大級の賞賛を得た。また『七つの封印を有する書』（09年）で三菱UFJ信託音楽賞を受賞、史上初のオーケストラ受賞例となった。
09年「ハイドン・プロジェクト」（指揮：フランス・ブリュッヘン）ではミュージック・ペンクラブ音楽賞を受賞。11年「ベートーヴェン・プロジェクト」（同指揮）でも再び各方面より絶賛を博した。
10年よりダニエル・ハーディングが“Music Partner of NJP”として指揮者陣に加入、11年6月に行われた東日本大震災チャリティーコンサートは世界的にも注目を集めたほか、東日本大震災当日の公演はNHKのドキュメンタリー番組になり大きな反響を呼んだ。
13年秋よりインゴ・メッツマッハーがConductor in Residenceに就任する。
近年の斬新な企画と優れた演奏は高く評価され、メディアでも「日本のオーケストラの新御三家のひとつ」として紹介されている。“常に新しい音楽性を探求する日本のオーケストラ”それが「新日本フィルハーモニー交響楽団」である。2012年、創立40周年を迎えた。

この法人は、目的を達成するため、次の事業を行う。
(1)演奏会の開催
(2)青少年に対する音楽の普及
(3)機関誌の刊行
(4)演奏に関する調査・研究 (5)その他 目的を達成するために必要な事業

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